Структура органов управления Общества в соответствии с Уставом ОАО «НПО ЦКТИ»

• Общее собрание акционеров;
• Совет директоров Общества;
• Единоличный исполнительный орган Общества - Генеральный директор;
• Коллегиальный исполнительный орган Общества - Правление.

Органом контроля за финансово-хозяйственной деятельностью Общества является Ревизионная комиссия.

В ОАО «НПО ЦКТИ» функционируют следующие научные отделения и отделы:

• Отделение теплообменного и схемного оборудования
• Отделение турбинных установок
• Отделение котельных установок
• Отдел перспективных разработок
• Отдел прочности и ресурса энергооборудования
• Испытательный центр энергетического оборудования

В ОАО «НПО ЦКТИ» функционируют следующие подразделения обеспечения научно-технической деятельности:

• Экспериментальная ТЭЦ.
• Отдел технического регулирования, лицензирования и информационного обеспечения.
• Технический архив.
• Группа информационных технологий.
• Электронно-технический архив.
• Научно-техническая библиотека.
• Цех изготовления нестандартизированного оборудования.
• Отдел обеспечения тендерных и электронных процедур.
• Отдел главного метролога.
• Сектор внешнеэкономических связей.
• Отдел по ремонту и обслуживанию основных фондов.
• Энергоцех.
• Отдел материально-технического снабжения и перевозок.
• Отдел охраны окружающей среды.
• Отдел охраны труда и промышленной безопасности.

Диссертационный совет.

С 1962 года в ОАО «НПО ЦКТИ» непрерывно действуют советы по защите докторских и кандидатских диссертаций. За это время было проведено 517 защит докторских и кандидатских диссертаций, подготовленных сотрудниками ЦКТИ и работниками предприятий отрасли.

Полномочия Совета по защите докторских и кандидатских диссертаций  (Диссертационного совета) на соискание ученых степеней доктора и кандидата наук Д 520.023.01 продлены приказом Рособрнадзора №105нк от 11.04.2012 г. на срок действия номенклатуры специальностей научных работников по специальностям:

05.14.14 – Тепловые электрические станции, их энергетические системы и агрегаты;

05.14.03 – Ядерные энергетические установки, их проектирование, эксплуатация и вывод из эксплуатации;

05.16.09 – Материаловедение (машиностроение).

В Обществе функционирует Научно-технический Совет (НТС).

В компетенцию НТС входит координация научно-технических направлений деятельности Общества.